Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spocd1B1ASB6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms