Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm438B1ASB3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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