Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc163A2AGD7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms