Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fbxo47A2A6H3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms