Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn2aA0A0J9YTW6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Scn2aA0A0J9YTW6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn2aA0A0J9YTW6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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