Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Trav14-2A0A075B694 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav14-2A0A075B694 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trav14-2A0A075B694 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav14-2A0A075B694 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Trav14-2A0A075B694 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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