Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ercc8Q8CFD5 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms