Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm4349-201ENSMUST00000181809 2559 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Trmt2b-202ENSMUST00000087541 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Aldh1a1-201ENSMUST00000087638 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Polr2l-201ENSMUST00000043870 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm25975-201ENSMUST00000158702 125 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm16206-201ENSMUST00000132485 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 AC154377.1-201ENSMUST00000226752 4979 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-207ENSMUST00000101213 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 C6-203ENSMUST00000162350 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dennd1b-202ENSMUST00000168527 8206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Depdc5-201ENSMUST00000049780 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Abcd3-204ENSMUST00000197383 3156 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm378-201ENSMUST00000120797 820 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm26562-201ENSMUST00000181113 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29336-201ENSMUST00000186042 573 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29120-201ENSMUST00000186111 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29371-201ENSMUST00000186823 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm21840-201ENSMUST00000187212 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29420-201ENSMUST00000187261 694 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms