Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Q3U6N9 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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Q3U6N9 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Q3U6N9 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Q3U6N9 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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