Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
P20040 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
P20040 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
P20040 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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