Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

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Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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DmdP11531 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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DmdP11531 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
DmdP11531 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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DmdP11531 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DmdP11531 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DmdP11531 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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