Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Ttc29Q80VM3 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ttc29Q80VM3 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ttc29Q80VM3 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms