Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SgcgP82348 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SgcgP82348 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SgcgP82348 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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