Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Vps8-201ENSMUST00000096191 4952 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp9yF8VPU6 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Usp9yF8VPU6 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Olfr531-202ENSMUST00000216053 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp9yF8VPU6 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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