Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ccdc18Q640L5 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc18Q640L5 Gm26749-201ENSMUST00000181387 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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