Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Prr5l-209ENSMUST00000163762 4159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Rsrc1-203ENSMUST00000065074 3224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Hsp90ab1-201ENSMUST00000024739 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrc43Q3V0L5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nuf2-201ENSMUST00000028000 2068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Apex2-204ENSMUST00000112721 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Clmn-202ENSMUST00000109937 3529 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ephx1-202ENSMUST00000111068 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrc43Q3V0L5 Acsbg2-201ENSMUST00000043062 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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