Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Traf3ip1Q149C2 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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Traf3ip1Q149C2 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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Traf3ip1Q149C2 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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Traf3ip1Q149C2 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Traf3ip1Q149C2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms