Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm44317-201ENSMUST00000204314 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
DmdP11531 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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DmdP11531 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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DmdP11531 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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DmdP11531 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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DmdP11531 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DmdP11531 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
DmdP11531 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
DmdP11531 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
DmdP11531 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DmdP11531 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms