Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rb1cc1Q9ESK9 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rb1cc1Q9ESK9 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rb1cc1Q9ESK9 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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