Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gimd1-204ENSMUST00000212804 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Vpreb1P13372 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Hcfc1r1-202ENSMUST00000179928 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mrgprx1-201ENSMUST00000094390 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms