Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NischQ80TM9 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms