Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
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PtprdQ64487 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprdQ64487 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprdQ64487 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprdQ64487 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprdQ64487 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PtprdQ64487 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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PtprdQ64487 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
PtprdQ64487 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms