Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Elavl2-203ENSMUST00000107109 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Elavl2-205ENSMUST00000107111 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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