Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms