Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms