Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ttc21bQ0HA38 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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