Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Rps10-208ENSMUST00000178774 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm9973-205ENSMUST00000223449 849 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC192434.1-201ENSMUST00000225464 390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Mir212-201ENSMUST00000083656 91 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC154729.1-201ENSMUST00000224481 1501 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Dppa1-201ENSMUST00000077173 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm13360-201ENSMUST00000121607 799 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 AC123692.1-201ENSMUST00000227514 730 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Irx2P81066 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Irx2P81066 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm3591-202ENSMUST00000179312 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm27651-201ENSMUST00000183465 246 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms