Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprkP35822 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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PtprkP35822 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprkP35822 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms