Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6bQ9Z331 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms