Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cib2Q9Z309 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cib2Q9Z309 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms