Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms