Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd2Q9Z2E1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd2Q9Z2E1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms