Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms