Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ilf3Q9Z1X4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ilf3Q9Z1X4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms