Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp5Q9Z131 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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Sh3bp5Q9Z131 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp5Q9Z131 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms