Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pus1Q9WU56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms