Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sema6cQ9WTM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms