Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH7Q9ULB5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH7Q9ULB5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH7Q9ULB5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH7Q9ULB5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH7Q9ULB5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms