Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc6Q9R1S7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcc6Q9R1S7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms