Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim3Q9R1R2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim3Q9R1R2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms