Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hsf4Q9R0L1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms