Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Copg1Q9QZE5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Copg1Q9QZE5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms