Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Homer2Q9QWW1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Homer2Q9QWW1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms