Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RhoaQ9QUI0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms