Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf19Q9JLL3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms