Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hip1rQ9JKY5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hip1rQ9JKY5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms