Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AtrQ9JKK8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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AtrQ9JKK8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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AtrQ9JKK8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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AtrQ9JKK8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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AtrQ9JKK8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrQ9JKK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
AtrQ9JKK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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