Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx6Q9JKK1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx6Q9JKK1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms