Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem1Q9JKE2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem1Q9JKE2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms