Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc22Q9JIG7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms